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    1. VPC視覺預測檢驗圖(2)在Phoenix NLME中繪制VPC圖

      2018-03-08 15:48:53 來源:源資科技市場部

      新聞摘要:本案例展示了如何使用Phoenix NLME繪制VPC圖形,并一步一步的說明了繪制相關的設置。

      概覽:

      一、示例文件

      二、了解數據

      三、繪制VPC圖(不對數據分組)

      四、繪制VPC圖(對數據分組)

      五、繪制VPC圖(同時繪制預測值的PI的置信區間)

      六、圖形繪制細節調整

      七、小節

       

      一、示例文件

      本示例使用的示例文件來自于Phoenix8.0的示例文件,文件路徑為C:\Program Files (x86)\Certara\Phoenix\application\Examples\NLME\Theo_Model.phxproj

       

      圖表 1

       

      二、了解數據

      1.雙擊“Theo_Model.phxproj”項目文件,在Phoenix中將該示例文件打開。

       

      圖表 2

       

      2.該示例中“Partial Diagonal Model tlag”對象是該數據所對應的最終模型,在左側對象瀏覽器中鼠標左鍵單擊該對象,之后在右側內容展示窗中的“Results(結果)”子選項卡下,選擇“Pop DV. IPRED vs IVAR”圖表,可查看個體預測曲線與觀測點對時間的散點圖。

       

      圖表 3

       

      三、繪制VPC圖(不對數據分組)

      1.選中項目文件中的最終模型“Partial Diagonal Model tlag”,復制并粘貼該模型,并將名稱更改為“VPC1”

      2.導航到“VPC1”對象的“Run Options”選項卡下,將運行模式切換為“Sim./Pred/Check”,

      #replicates: (重復次數)設定為10,然后執行該對象。

       

      圖表 4

       

      3.執行完成,在其“Results(結果)”子選項卡下導航至其圖表結果“Pop PredCheck ObsQ_SimQ”,可在右側查看到其VPC圖形

       

      圖表 5

       

      為什么圖形看起來會這么糟糕呢?

      因為沒有對圖中的數據分組(或者說分段),接下來我們重新繪制一下VPC圖形,在繪制的同時進行分組。

       

      四、繪制VPC圖(對數據分組)

      1.首先復制操作對象VPC1,將新的操作對象命名為VPC2;

      2.導航至其Run Options標簽頁,勾選“Keep?,固定隨機種子;

      3.接著來到“Binning(分組)子標簽頁,下拉“Binning Option(分組選項)”下拉框,選擇“Explicit Centers(指定分組的中心),然后在出現的對話框中輸入數值序列“0,0.25,0.5,1,2,4,5,7,9,12,24”(輸入時不需要輸入引號,逗號需要為英文半角逗號);

       

       

      圖表 6

       

      Binning Option(分組選項)”提供了四種分組方式:None不分組,K-means應用K-means算法對數據分組,Explicit centers用戶指每組的中心對數據進行分組,Explicit boundaries用戶指定組與組的邊界值進行分組,之后執行操作對象;

      4.執行完成,在其“Results(結果)”子選項卡下導航至其圖表結果“Pop PredCheck ObsQ_SimQ”,可在右側查看到其VPC圖形;

       

      圖表 7

       

      這樣我們就繪制得到了一個典型的VPC圖。

       

      五、繪制VPC圖(同時繪制預測值的PI的置信區間)

      1.復制VPC2對象,并命名為VPC3

      2.導航的VPC3Run Options標簽頁

      3.選擇“Predictive Check Options”的子選項卡“Qunantiles(分位數),勾選“Qunantile%”選項,之后執行操作對象;

       

      圖表 8

       

      4.執行完成,在其“Results(結果)”子選項卡下導航至其圖表結果“Pop PredCheck ObsQ_SimQCI”,可在右側查看到其VPC圖形;

       

      圖表 9

       

      六、圖形繪制細節調整

      如果希望修改圖表中的繪制風格,可雙擊擬修改的圖表將其在新的窗口中打開,然后就可以通過圖表下部的菜單來修改圖片。

       

      圖表 10

       

      圖表 11

       

      七、小節

      到此我們就繪制得到了們平常所見到的幾種VPC圖,通過Phoenix Model,我們可以方便快速的繪制出我們想要的VPC圖,以滿足報告要求;在下次案例分享,將通過手工繪制的方式,一步一步的繪制出VPC圖,使大家可以更加容易理解VPC圖的繪制原理。

       

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